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T5核酸外切酶在基因編輯中確實有應(yīng)用,并且具有一些優(yōu)勢:1.**提高編輯效率**:根據(jù)一篇研究文章,T5核酸外切酶可以與CRISPR/Cas系統(tǒng)共表達或融合,以提高基因編輯的效率。這種共表達或融合可以增加indel(插入和缺失)頻率,盡管增加的幅度可能不大。2.**增強基因編輯效果**:在另一項研究中,通過使用螺旋-螺旋二聚體肽(coiled-coilpeptides)將T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因編輯的效率,這種方法被稱為CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。這種招募方式優(yōu)于共表達和直接融合,其中強的親和力CC對顯示出高的突變頻率和刪除長度。3.**應(yīng)用于多種細胞類型**:CCExo系統(tǒng)在多種細胞系和原代細胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血?。–ML)患者的原代細胞以及異種移植動物模型中展示了其應(yīng)用潛力,這表明CCExo方法可能成為CML和其他遺傳性疾病的潛在選擇。T5核酸外切酶與CRISPR核酸酶蛋白進行融合,并引入了核定位信號(NLS)序列以構(gòu)建表達載體,用于基因編輯。綜上所述,T5核酸外切酶在基因編輯中的應(yīng)用可以增強編輯效率和效果,尤其是在與CRISPR/Cas系統(tǒng)結(jié)合使用時。將含有重組質(zhì)粒的表達載體轉(zhuǎn)化到宿主細胞中,通常是大腸桿菌或其他合適的細胞系。核糖核酸酶T1
T5核酸外切酶(T5Exonuclease)具有以下特點和技術(shù)應(yīng)用:1.**降解方向**:T5核酸外切酶按照5'→3'方向降解雙鏈或單鏈DNA。2.**起始消化位置**:T5核酸外切酶既能從單鏈或雙鏈DNA的5'末端起始消化,也可以從線性或環(huán)狀雙鏈DNA的缺口(gap)或缺刻(nick)處起始消化。3.**對超螺旋雙鏈DNA的作用**:T5核酸外切酶無法降解超螺旋雙鏈DNA。4.**單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性**:T5核酸外切酶還具有單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性。5.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-用于Gibson組裝,這是一種在恒溫條件下有效連接帶有多個重疊序列片段的技術(shù)。-從完全連接的環(huán)狀雙鏈DNA中去除不完全連接產(chǎn)物。-降解堿裂解質(zhì)粒提取方法中產(chǎn)生的變性DNA,增加超螺旋DNA比例,提高DNA克隆和轉(zhuǎn)染效率。-降解質(zhì)粒樣品中污染的線性化和切刻DNA。6.**操作條件**:推薦在37℃溫育30分鐘,之后加入EDTA至終濃度為20mM終止反應(yīng)。7.**儲存條件**:-25~-15℃保存,有效期3年。8.**注意事項**:避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止本品失活。這些特點和技術(shù)應(yīng)用使得T5核酸外切酶在分子生物學(xué)實驗中,尤其是在DNA克隆和基因片段組裝中,具有重要的應(yīng)用價值。Recombinant Cynomolgus CD83 Protein,His TagMultiplex Probe qPCR Mix 已預(yù)混了低濃度ROX參比染料,適用于需要低濃度ROX校正的熒光定量PCR儀 。
確保Cre重組酶只作用于特定細胞,主要通過以下幾種方式實現(xiàn):1.**組織特異性啟動子**:-利用組織特異性啟動子控制Cre重組酶的表達,可以確保Cre酶只在特定組織或細胞中表達。這種方法通過將Cre基因置于特定細胞類型特有的啟動子控制之下,實現(xiàn)對Cre酶表達的精確控制。2.**誘導(dǎo)型Cre重組酶系統(tǒng)**:-通過使用Cre-ERT(雌素受體突變體與Cre重組酶的融合蛋白),可以實現(xiàn)對Cre活性的時間控制。在無他莫昔芬誘導(dǎo)時,Cre-ERT與熱激蛋白Hsp90結(jié)合,定位于細胞質(zhì)中;當(dāng)他莫昔芬給藥誘導(dǎo)時,Hsp90脫離Cre-ERT,使Cre-ERT進入細胞核發(fā)揮基因重組的作用。這種系統(tǒng)相當(dāng)于為Cre-Lox系統(tǒng)加裝了一個由他莫昔芬控制的外源開關(guān),使得體內(nèi)基因編輯更具時空靈活性。3.**藥物誘導(dǎo)的Cre系統(tǒng)**:-例如Tet-on系統(tǒng),通過四環(huán)素或其衍生物多西環(huán)素的添加來激起基因表達。在三重轉(zhuǎn)基因動物中,rtTA在特定啟動子的控制下表達,多西環(huán)素與rtTA結(jié)合,Cre的表達,導(dǎo)致固定的報告基因重組。4.**AAV遞送Cre**:-利用包含組織特異性啟動子的腺相關(guān)病毒(AAV)載體可以選擇性地將Cre重組酶遞送至特定細胞。
牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)在實驗室中的使用主要涉及以下幾個步驟:1.**DNA載體連接**:-牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I可以用于DNA載體連接,特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT],并與DNA形成共價連接形成穩(wěn)定復(fù)合物,遇到DNA的5’-OH基團后,重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**:-在NGS建庫中,牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育,以實現(xiàn)DNA片段的連接。3.**操作步驟**:-**質(zhì)粒解旋**:將超螺旋質(zhì)粒DNA與牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實現(xiàn)質(zhì)粒的解旋。-**接頭連接**:將接頭A(含CCCTT序列)和接頭B(含5’OH)與牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實現(xiàn)接頭的連接。4.**注意事項**:-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾,以防止自連接;接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴,再長的尾巴會導(dǎo)致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應(yīng)用廣,在不同的實驗中使用策略不同,需要靈活運用,并根據(jù)具體文獻進行調(diào)整。
通過工程化改造,如將FnCas12a與單鏈DNA外切酶融合,可以提高基因編輯效率,擴大FnCas12a可以靶向的范圍 。
牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)是一種來源于牛痘病毒的I型真核拓撲異構(gòu)酶,具有以下功能和應(yīng)用:1.**功能**:-牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I可以催化雙鏈DNA分子中單鏈DNA特定序列位置的磷酸二酯鍵的斷開和連接。-具有解超螺旋的酶(DNARelaxingEnzyme)活性,能夠通過快速的酶切和連接使雙鏈共價閉合環(huán)狀的正或負超螺旋DNA發(fā)生解超螺旋,形成含有較少的正或負超螺旋的雙鏈環(huán)狀DNA分子。-能夠使雙鏈DNA形成繩結(jié)(knotting)或解開繩結(jié)(unknotting),聯(lián)結(jié)互補的單鏈環(huán)狀DNA成為雙鏈環(huán)狀DNA。2.**應(yīng)用**:-作為一種DNA重組連接的新型工具酶,用于DNA載體和重組片段的連接、缺刻修復(fù)、接頭連接等。-適用于TOPO克隆載體的制備、NGS建庫中的接頭連接等。-在TOPO克隆技術(shù)中,DNA拓撲異構(gòu)酶I同時具有限制酶和連接酶特性,其生物學(xué)功能是在復(fù)制期間切割并重新連接DNA。3.**使用方法**:-用于DNA快速酶切流程,包括配制體系反應(yīng)液、輕柔混勻、37℃孵育15分鐘等步驟。4.**儲存條件**:-建議在-25~-15℃保存,有效期為3年。5.**注意事項**:-避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止酶失活。牛痘DNA拓撲異構(gòu)酶I因其獨特的功能,在分子生物學(xué)研究和基因工程中扮演著重要的角色。泛素激起酶E1(Ubiquitin-activating enzyme E1)在ATP的存在下激發(fā)泛素分子,形成E1-泛素硫酯中間體。Recombinant Protein A (Freeze-Dried) 重組蛋白A (凍干)
FnCas12a不僅可用于體外dsDNA的特異剪切,也可用于靶標核酸的快速檢測,如HOLMES核酸快檢技術(shù)。核糖核酸酶T1
磁珠法DNA凝膠回收試劑盒是一種用于從DNA瓊脂糖凝膠中回收特定DNA片段的實驗室工具。與傳統(tǒng)的柱純化方法相比,磁珠法具有多個優(yōu)勢:1.**操作簡便快捷**:磁珠法DNA凝膠回收試劑盒的操作步驟通常包括凝膠的融化、DNA的結(jié)合、磁珠的洗滌和DNA的洗脫,整個過程可以在20分鐘內(nèi)完成。2.**高純度和高回收率**:磁珠法能夠穩(wěn)定、高效地從凝膠中回收DNA,純化所得的DNA可直接用于酶切、連接、轉(zhuǎn)化細菌、測序、PCR、雜交等后續(xù)操作。通常回收率達到60-80%,對于200bp以下小片段和10kb以上大片段的回收率有所下降。3.**適用性廣**:適用于100bp以上DNA片段的純化,對達到10kb片段DNA的純化也能保持較好的效果。4.**安全性高**:操作過程中不涉及酚/氯仿等有毒試劑,更加環(huán)保和安全。5.**靈活性**:可以根據(jù)實際狀況靈活調(diào)節(jié)磁珠用量,適應(yīng)不同體積和濃度的樣品處理。6.**自動化和高通量**:磁珠法純化試劑盒適合手工操作,也可用于自動化工作站或核酸自動提取儀,實現(xiàn)高通量操作。核糖核酸酶T1