陜西二代測(cè)序流程

對(duì)于二代測(cè)序的概念是什么？

第二代測(cè)序(Next-generationsequencing，NGS)又稱為高通量測(cè)序(High-throughputsequencing)，是基于PCR和基因芯片發(fā)展而來的DNA測(cè)序技術(shù)。我們都知道一代測(cè)序?yàn)楹铣山K止測(cè)序，而二代測(cè)序開創(chuàng)性的引入了可逆終止末端，從而實(shí)現(xiàn)邊合成邊測(cè)序(SequencingbySynthesis)。二代測(cè)序在DNA復(fù)制過程中通過捕捉新添加的堿基所攜帶的特殊標(biāo)記(一般為熒光分子標(biāo)記)來確定DNA的序列，現(xiàn)有的技術(shù)平臺(tái)主要包括Roche的454FLX、lllumina的Miseq/Hiseg等。2005年，羅氏推出了二代測(cè)序儀羅氏454，生命科學(xué)開始進(jìn)入高通量測(cè)序時(shí)代。2006年，隨著Ilumina系列測(cè)序平臺(tái)的推出，極大降低了二代測(cè)序的價(jià)格，推動(dòng)了高通量測(cè)序在生命科學(xué)各個(gè)研究領(lǐng)域的普及。 二代測(cè)序讀長(zhǎng)方面比一代測(cè)序短很多。陜西二代測(cè)序流程

二代測(cè)序——基因組測(cè)序該測(cè)幾個(gè)G？

1、人類全基因組測(cè)序

常規(guī)全基因組測(cè)序：一般建議測(cè)序深度為30X-50X，人類基因組大小約為3G，因此數(shù)據(jù)量通常在90G-150G左右。這樣的測(cè)序深度可以較為***地檢測(cè)到基因組中的各種變異，包括單核苷酸多態(tài)性（SNP）、插入缺失（Indel）、結(jié)構(gòu)變異（SV）等，適用于大多數(shù)疾病研究、群體遺傳學(xué)研究以及個(gè)體遺傳特征分析等。

高深度全基因組測(cè)序：對(duì)于一些特殊的研究目的，如檢測(cè)低頻變異、體細(xì)胞突變等，可能需要更高的測(cè)序深度，達(dá)到100X甚至更高。此時(shí)數(shù)據(jù)量會(huì)相應(yīng)增加到300G及以上，這種高深度測(cè)序能夠更靈敏地發(fā)現(xiàn)罕見的遺傳變異，但成本也會(huì)大幅提高。 河南嘉安健達(dá)二代測(cè)序公司高通量測(cè)序是二代測(cè)序嗎？

什么樣本可以做二代測(cè)序？①

1、血液樣本

全血：這是最常見的樣本類型之一。血液中含有白細(xì)胞，其細(xì)胞核內(nèi)有完整的基因組DNA。通過提取白細(xì)胞中的DNA，可以進(jìn)行全基因組測(cè)序、全外顯子組測(cè)序等。例如，在遺傳病的基因診斷中，抽取患者的全血，提取DNA后，對(duì)與疾病相關(guān)的基因或整個(gè)外顯子組進(jìn)行測(cè)序，以尋找致病突變。

血漿/血清：其中含有游離的DNA（cfDNA）和RNA（cfRNA）。在**患者中，腫瘤細(xì)胞會(huì)釋放其DNA片段進(jìn)入血液循環(huán)，這些cfDNA被稱為循環(huán)**DNA（ctDNA）。通過對(duì)血漿中的ctDNA進(jìn)行測(cè)序，可以實(shí)現(xiàn)**的早期篩查、***過程中的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)等。例如，對(duì)于肺*患者，檢測(cè)血漿中的ctDNA來追蹤**的基因突變情況，為靶向***提供依據(jù)。

二代測(cè)序不同應(yīng)用場(chǎng)景下的速度有多快？

病原微生物檢測(cè)：一般來說，二代測(cè)序用于檢測(cè)病原微生物時(shí)，能夠在幾個(gè)小時(shí)到一天左右出結(jié)果。比如在快速檢測(cè)血液中的病原微生物時(shí)，通常可以在幾個(gè)小時(shí)內(nèi)獲得檢測(cè)結(jié)果，相比傳統(tǒng)的血液培養(yǎng)方法，時(shí)間大幅縮短，傳統(tǒng)血液培養(yǎng)一般需要幾天到一周的時(shí)間 。

全基因組測(cè)序：如果是對(duì)人類全基因組進(jìn)行測(cè)序，以目前的技術(shù)水平，使用二代測(cè)序技術(shù)完成一個(gè)人的全基因組測(cè)序，一般需要 1-2 天左右的時(shí)間。而在十幾年前，人類全基因組測(cè)序計(jì)劃***完成時(shí)，耗費(fèi)了大量的時(shí)間和精力，相比之下二代測(cè)序技術(shù)的速度提升***。

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的時(shí)間相對(duì)較短，一般幾個(gè)小時(shí)內(nèi)可以完成對(duì)大量 RNA 分子的測(cè)序和初步數(shù)據(jù)分析，進(jìn)而快速了解基因在特定條件下的表達(dá)情況8. 二代測(cè)序是先打斷DNA，使其片段化。

二代測(cè)序—全外顯子測(cè)序的優(yōu)勢(shì)

針對(duì)性強(qiáng)：它主要聚焦于基因組中編碼蛋白質(zhì)的區(qū)域，這部分區(qū)域雖然只占整個(gè)基因組的 1 - 2% 左右，但包含了大部分與疾病相關(guān)的突變。例如，在研究孟德爾遺傳病時(shí)，很多致病突變都位于外顯子區(qū)域，通過全外顯子測(cè)序可以更高效地找到這些突變。

成本效益高：相比于全基因組測(cè)序，全外顯子測(cè)序的成本相對(duì)較低。因?yàn)樗恍枰獙?duì)整個(gè)基因組（包括大量的非編碼區(qū)域）進(jìn)行測(cè)序，在一定程度上減少了數(shù)據(jù)量和測(cè)序成本，同時(shí)又能獲取大部分有重要功能意義的遺傳信息。 二代測(cè)序的優(yōu)勢(shì)是高準(zhǔn)確性。湖北哪里有二代測(cè)序檢測(cè)

二代測(cè)序常用于產(chǎn)前的檢測(cè)或診斷。陜西二代測(cè)序流程

二代測(cè)序——轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的應(yīng)用領(lǐng)域

1、基礎(chǔ)生物學(xué)研究：可以用于研究生物的發(fā)育過程。例如，在胚胎發(fā)育過程中，通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可以了解不同階段胚胎細(xì)胞中基因的表達(dá)變化，揭示胚胎發(fā)育的分子機(jī)制。還可以用于物種進(jìn)化研究，比較不同物種間轉(zhuǎn)錄組的差異，推斷基因表達(dá)的進(jìn)化模式。

2、醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷：在疾病研究方面，用于尋找疾病相關(guān)的生物標(biāo)志物。例如，在**研究中，通過對(duì)比**組織和正常組織的轉(zhuǎn)錄組，可以發(fā)現(xiàn)一些在**中特異性高表達(dá)或低表達(dá)的基因，這些基因有望成為**診斷、預(yù)后判斷的標(biāo)志物。同時(shí)，也可以用于藥物研發(fā)，通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序了解藥物作用后細(xì)胞基因表達(dá)的變化，評(píng)估藥物療效和毒性。

3、農(nóng)業(yè)和植物學(xué)研究：在作物育種中，可以研究不同品種作物在抗逆性（如抗旱、抗寒、抗病）等方面的基因表達(dá)差異，為培育優(yōu)良品種提供理論依據(jù)。在植物生長(zhǎng)發(fā)育研究中，分析植物在不同生長(zhǎng)環(huán)境和生長(zhǎng)階段的轉(zhuǎn)錄組變化，了解植物***等因素對(duì)植物生長(zhǎng)的調(diào)控機(jī)制。 陜西二代測(cè)序流程